云南省中医院儿科创建于1953年，是我省中医特色非常突出的中医专科，本科室为全国重点学科，全国中西医结合特色群儿科重点学科，云南省中医儿科重点专科。1995年成为了第一批国家新药药物临床试验基地。
儿科历史悠久，名医辈出如康诚之、李家凤、刘以敏等中医儿科名家。他们以高尚的医德、精湛的医术在群众中享有极高的声誉。目前国家级名中医刘以敏教授、云南省名中医熊磊教授担任科室的学术带头人，何平主任医师、教授担任科室的学科带头人科室主任，董丽萍为科室护士长。科室现有医护人员30余名，国家级名中医学术继承人4人，副主任医师以上专家11人，博士1人，硕士10人。承担省部级科研课题10余项，出版专著10余部，发表论文100余篇。
儿科现开设专家门诊、普通门诊、夜门诊、住院部、抢救室、输液留观室，全天24小时(包括节假日)应诊。儿科即将开设特色门诊：小儿哮喘，慢性咳嗽。